Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA6P31267 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA6P31267 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms