Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms