Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms