Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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PTPROQ16827 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPROQ16827 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPROQ16827 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPROQ16827 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPROQ16827 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPROQ16827 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPROQ16827 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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PTPROQ16827 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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PTPROQ16827 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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PTPROQ16827 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPROQ16827 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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PTPROQ16827 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPROQ16827 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
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PTPROQ16827 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPROQ16827 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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PTPROQ16827 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
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PTPROQ16827 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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PTPROQ16827 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.68□□□□□ -2.68
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PTPROQ16827 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPROQ16827 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPROQ16827 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPROQ16827 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPROQ16827 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPROQ16827 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPROQ16827 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPROQ16827 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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