Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
SPTAN1Q13813 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
SPTAN1Q13813 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
SPTAN1Q13813 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
SPTAN1Q13813 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SPTAN1Q13813 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-4.51□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
SPTAN1Q13813 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-4.55□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
SPTAN1Q13813 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-4.6□□□□□ -3.15
SPTAN1Q13813 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
SPTAN1Q13813 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
SPTAN1Q13813 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
SPTAN1Q13813 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
SPTAN1Q13813 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.15
SPTAN1Q13813 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-4.66□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
SPTAN1Q13813 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-4.78□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-4.78□□□□□ -3.17
SPTAN1Q13813 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-4.79□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
SPTAN1Q13813 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
SPTAN1Q13813 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
SPTAN1Q13813 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
SPTAN1Q13813 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
SPTAN1Q13813 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
SPTAN1Q13813 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-4.88□□□□□ -3.19
SPTAN1Q13813 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.88□□□□□ -3.19
SPTAN1Q13813 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-4.88□□□□□ -3.19
SPTAN1Q13813 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
SPTAN1Q13813 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
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