Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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PTCH1Q13635 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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PTCH1Q13635 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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PTCH1Q13635 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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