Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTCH1Q13635 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTCH1Q13635 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTCH1Q13635 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTCH1Q13635 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTCH1Q13635 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTCH1Q13635 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.8 ms