Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NAE1Q13564 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NAE1Q13564 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NAE1Q13564 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NAE1Q13564 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
NAE1Q13564 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
NAE1Q13564 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NAE1Q13564 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NAE1Q13564 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NAE1Q13564 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NAE1Q13564 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NAE1Q13564 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NAE1Q13564 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NAE1Q13564 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NAE1Q13564 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NAE1Q13564 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
NAE1Q13564 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NAE1Q13564 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NAE1Q13564 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NAE1Q13564 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NAE1Q13564 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NAE1Q13564 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
NAE1Q13564 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
NAE1Q13564 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
NAE1Q13564 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NAE1Q13564 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NAE1Q13564 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
NAE1Q13564 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
NAE1Q13564 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NAE1Q13564 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NAE1Q13564 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NAE1Q13564 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.41□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
NAE1Q13564 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
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