Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
RLFQ13129 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
RLFQ13129 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
RLFQ13129 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
RLFQ13129 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
RLFQ13129 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
RLFQ13129 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RLFQ13129 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RLFQ13129 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RLFQ13129 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RLFQ13129 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RLFQ13129 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RLFQ13129 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RLFQ13129 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RLFQ13129 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RLFQ13129 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RLFQ13129 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RLFQ13129 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RLFQ13129 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RLFQ13129 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RLFQ13129 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
RLFQ13129 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RLFQ13129 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RLFQ13129 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RLFQ13129 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RLFQ13129 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RLFQ13129 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
RLFQ13129 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RLFQ13129 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RLFQ13129 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
RLFQ13129 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RLFQ13129 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RLFQ13129 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RLFQ13129 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RLFQ13129 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RLFQ13129 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.65□□□□□ -2.67
RLFQ13129 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
RLFQ13129 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
RLFQ13129 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RLFQ13129 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RLFQ13129 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RLFQ13129 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RLFQ13129 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RLFQ13129 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RLFQ13129 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RLFQ13129 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RLFQ13129 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RLFQ13129 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RLFQ13129 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RLFQ13129 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RLFQ13129 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RLFQ13129 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RLFQ13129 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RLFQ13129 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
RLFQ13129 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
RLFQ13129 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
RLFQ13129 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RLFQ13129 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RLFQ13129 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RLFQ13129 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RLFQ13129 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
RLFQ13129 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RLFQ13129 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RLFQ13129 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RLFQ13129 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RLFQ13129 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
RLFQ13129 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RLFQ13129 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RLFQ13129 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RLFQ13129 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RLFQ13129 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RLFQ13129 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
RLFQ13129 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RLFQ13129 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RLFQ13129 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RLFQ13129 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RLFQ13129 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RLFQ13129 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RLFQ13129 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RLFQ13129 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RLFQ13129 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RLFQ13129 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RLFQ13129 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RLFQ13129 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RLFQ13129 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RLFQ13129 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RLFQ13129 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RLFQ13129 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RLFQ13129 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RLFQ13129 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RLFQ13129 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RLFQ13129 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
RLFQ13129 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RLFQ13129 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RLFQ13129 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RLFQ13129 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RLFQ13129 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RLFQ13129 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RLFQ13129 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RLFQ13129 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms