Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
GINS3Q9BRX5 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.08□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
GINS3Q9BRX5 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
GINS3Q9BRX5 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
GINS3Q9BRX5 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
GINS3Q9BRX5 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
GINS3Q9BRX5 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
GINS3Q9BRX5 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
GINS3Q9BRX5 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
GINS3Q9BRX5 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
GINS3Q9BRX5 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-4.28□□□□□ -3.09
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
GINS3Q9BRX5 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
GINS3Q9BRX5 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
GINS3Q9BRX5 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.31□□□□□ -3.1
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
GINS3Q9BRX5 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
GINS3Q9BRX5 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
GINS3Q9BRX5 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms