Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-3.65□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SIGMAR1Q99720 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.72□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SIGMAR1Q99720 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-3.73□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SIGMAR1Q99720 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.3 ms