Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
C9orf116Q5BN46 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
C9orf116Q5BN46 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
C9orf116Q5BN46 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
C9orf116Q5BN46 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
C9orf116Q5BN46 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
C9orf116Q5BN46 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
C9orf116Q5BN46 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.91□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-3.95□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
C9orf116Q5BN46 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.13□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
C9orf116Q5BN46 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
C9orf116Q5BN46 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
C9orf116Q5BN46 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.7 ms