Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
RTL8BQ17RB0 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
RTL8BQ17RB0 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
RTL8BQ17RB0 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-4.1□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.14□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
RTL8BQ17RB0 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-4.2□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
RTL8BQ17RB0 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
RTL8BQ17RB0 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
RTL8BQ17RB0 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
RTL8BQ17RB0 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
RTL8BQ17RB0 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-4.37□□□□□ -3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.3 ms