Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
FSCN1Q16658 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
FSCN1Q16658 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
FSCN1Q16658 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
FSCN1Q16658 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
FSCN1Q16658 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
FSCN1Q16658 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
FSCN1Q16658 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FSCN1Q16658 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FSCN1Q16658 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
FSCN1Q16658 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
FSCN1Q16658 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
FSCN1Q16658 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
FSCN1Q16658 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
FSCN1Q16658 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
FSCN1Q16658 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
FSCN1Q16658 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
FSCN1Q16658 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
FSCN1Q16658 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
FSCN1Q16658 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms