Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MADCAM1Q13477 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MADCAM1Q13477 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
MADCAM1Q13477 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MADCAM1Q13477 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MADCAM1Q13477 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MADCAM1Q13477 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MADCAM1Q13477 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MADCAM1Q13477 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
MADCAM1Q13477 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
MADCAM1Q13477 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
MADCAM1Q13477 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms