Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SP140Q13342 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SP140Q13342 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SP140Q13342 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SP140Q13342 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SP140Q13342 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SP140Q13342 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SP140Q13342 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SP140Q13342 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SP140Q13342 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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SP140Q13342 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SP140Q13342 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SP140Q13342 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SP140Q13342 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SP140Q13342 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SP140Q13342 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SP140Q13342 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SP140Q13342 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SP140Q13342 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SP140Q13342 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SP140Q13342 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SP140Q13342 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SP140Q13342 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SP140Q13342 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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SP140Q13342 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SP140Q13342 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SP140Q13342 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SP140Q13342 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SP140Q13342 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SP140Q13342 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SP140Q13342 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SP140Q13342 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SP140Q13342 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SP140Q13342 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SP140Q13342 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SP140Q13342 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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SP140Q13342 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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SP140Q13342 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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SP140Q13342 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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SP140Q13342 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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SP140Q13342 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SP140Q13342 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SP140Q13342 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SP140Q13342 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SP140Q13342 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SP140Q13342 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SP140Q13342 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SP140Q13342 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SP140Q13342 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SP140Q13342 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SP140Q13342 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SP140Q13342 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SP140Q13342 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SP140Q13342 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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