Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTP4A2Q12974 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTP4A2Q12974 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTP4A2Q12974 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.3 ms