Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
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