Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRXP46100 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRXP46100 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRXP46100 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRXP46100 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRXP46100 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRXP46100 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRXP46100 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATRXP46100 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRXP46100 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRXP46100 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRXP46100 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRXP46100 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRXP46100 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRXP46100 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRXP46100 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRXP46100 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRXP46100 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRXP46100 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRXP46100 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRXP46100 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRXP46100 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRXP46100 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRXP46100 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRXP46100 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRXP46100 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRXP46100 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRXP46100 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRXP46100 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRXP46100 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRXP46100 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATRXP46100 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRXP46100 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRXP46100 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRXP46100 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRXP46100 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATRXP46100 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRXP46100 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRXP46100 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRXP46100 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ATRXP46100 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ATRXP46100 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ATRXP46100 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRXP46100 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRXP46100 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRXP46100 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRXP46100 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRXP46100 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRXP46100 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRXP46100 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRXP46100 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRXP46100 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRXP46100 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRXP46100 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRXP46100 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRXP46100 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRXP46100 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRXP46100 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRXP46100 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRXP46100 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRXP46100 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRXP46100 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRXP46100 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRXP46100 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRXP46100 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRXP46100 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRXP46100 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRXP46100 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRXP46100 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRXP46100 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRXP46100 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATRXP46100 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATRXP46100 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATRXP46100 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRXP46100 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRXP46100 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRXP46100 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRXP46100 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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