Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TSPOP30536 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TSPOP30536 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TSPOP30536 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TSPOP30536 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TSPOP30536 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TSPOP30536 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TSPOP30536 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TSPOP30536 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TSPOP30536 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TSPOP30536 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TSPOP30536 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TSPOP30536 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TSPOP30536 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TSPOP30536 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TSPOP30536 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TSPOP30536 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TSPOP30536 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TSPOP30536 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TSPOP30536 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TSPOP30536 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TSPOP30536 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TSPOP30536 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TSPOP30536 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
TSPOP30536 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TSPOP30536 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TSPOP30536 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TSPOP30536 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TSPOP30536 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TSPOP30536 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TSPOP30536 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TSPOP30536 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TSPOP30536 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TSPOP30536 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TSPOP30536 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TSPOP30536 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TSPOP30536 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TSPOP30536 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TSPOP30536 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TSPOP30536 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TSPOP30536 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TSPOP30536 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TSPOP30536 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TSPOP30536 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TSPOP30536 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
TSPOP30536 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TSPOP30536 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TSPOP30536 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TSPOP30536 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TSPOP30536 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TSPOP30536 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TSPOP30536 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TSPOP30536 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TSPOP30536 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TSPOP30536 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TSPOP30536 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TSPOP30536 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TSPOP30536 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TSPOP30536 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TSPOP30536 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TSPOP30536 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TSPOP30536 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TSPOP30536 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TSPOP30536 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TSPOP30536 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TSPOP30536 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TSPOP30536 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TSPOP30536 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TSPOP30536 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.63□□□□□ -2.83
TSPOP30536 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TSPOP30536 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TSPOP30536 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TSPOP30536 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TSPOP30536 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TSPOP30536 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TSPOP30536 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TSPOP30536 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TSPOP30536 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TSPOP30536 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TSPOP30536 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TSPOP30536 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TSPOP30536 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TSPOP30536 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TSPOP30536 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.69□□□□□ -2.84
TSPOP30536 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TSPOP30536 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TSPOP30536 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TSPOP30536 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms