Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
PTPRMP28827 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
PTPRMP28827 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
PTPRMP28827 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
PTPRMP28827 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
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PTPRMP28827 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
PTPRMP28827 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
PTPRMP28827 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
PTPRMP28827 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
PTPRMP28827 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
PTPRMP28827 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
PTPRMP28827 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
PTPRMP28827 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
PTPRMP28827 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
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PTPRMP28827 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
PTPRMP28827 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
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PTPRMP28827 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
PTPRMP28827 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-4.01□□□□□ -3.05
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PTPRMP28827 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
PTPRMP28827 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
PTPRMP28827 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
PTPRMP28827 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
PTPRMP28827 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
PTPRMP28827 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
PTPRMP28827 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
PTPRMP28827 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
PTPRMP28827 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
PTPRMP28827 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
PTPRMP28827 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
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