Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SGCEO43556 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SGCEO43556 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SGCEO43556 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SGCEO43556 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SGCEO43556 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SGCEO43556 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SGCEO43556 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SGCEO43556 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SGCEO43556 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SGCEO43556 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SGCEO43556 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SGCEO43556 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SGCEO43556 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SGCEO43556 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.66□□□□□ -2.84
SGCEO43556 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SGCEO43556 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SGCEO43556 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SGCEO43556 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SGCEO43556 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SGCEO43556 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SGCEO43556 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SGCEO43556 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SGCEO43556 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SGCEO43556 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SGCEO43556 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SGCEO43556 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SGCEO43556 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SGCEO43556 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SGCEO43556 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SGCEO43556 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SGCEO43556 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SGCEO43556 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SGCEO43556 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SGCEO43556 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SGCEO43556 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SGCEO43556 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SGCEO43556 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SGCEO43556 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SGCEO43556 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SGCEO43556 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SGCEO43556 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SGCEO43556 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SGCEO43556 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SGCEO43556 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SGCEO43556 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SGCEO43556 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SGCEO43556 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SGCEO43556 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SGCEO43556 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SGCEO43556 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SGCEO43556 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SGCEO43556 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SGCEO43556 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
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SGCEO43556 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
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SGCEO43556 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
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SGCEO43556 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
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SGCEO43556 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SGCEO43556 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SGCEO43556 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SGCEO43556 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SGCEO43556 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.89□□□□□ -2.87
SGCEO43556 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SGCEO43556 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SGCEO43556 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.9□□□□□ -2.87
SGCEO43556 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SGCEO43556 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SGCEO43556 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SGCEO43556 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
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