Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
POLR1DQ9Y2S0 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
POLR1DQ9Y2S0 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
POLR1DQ9Y2S0 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
POLR1DQ9Y2S0 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms