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Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5
UBQLN4, Ubiquilin-4, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
UBQLN4
Q9NRR5
RNA5SP215-201
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122 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.475-201
ENST00000384345
101 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-554P-201
ENST00000410466
106 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MTND4LP1-201
ENST00000446263
157 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MIRLET7A2-201
ENST00000362105
72 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MIRLET7A1-201
ENST00000362295
80 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.139-201
ENST00000363464
102 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-379P-201
ENST00000363813
104 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-686P-201
ENST00000364839
107 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MIR125B1-201
ENST00000385236
88 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MIR1302-5-201
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150 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MTATP8P2-201
ENST00000435212
202 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-182P-201
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105 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-388P-201
ENST00000517012
105 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-389P-201
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105 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.71-201
ENST00000362892
104 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-106P-201
ENST00000384405
107 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MT-TM-201
ENST00000387377
68 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6ATAC23P-201
ENST00000408448
123 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.620-201
ENST00000411009
88 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU7-200P-201
ENST00000516105
62 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-557P-201
ENST00000516842
110 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MIR548BB-201
ENST00000626714
66 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MIR202-201
ENST00000362219
110 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.257-201
ENST00000364596
102 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-219P-201
ENST00000364728
107 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-867P-201
ENST00000364956
107 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1306P-201
ENST00000365219
99 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.489-201
ENST00000384410
101 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
TRAJ53-201
ENST00000390485
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MIR466-201
ENST00000580653
84 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-119P-201
ENST00000364882
107 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MIR496-201
ENST00000385226
102 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-402P-201
ENST00000410678
103 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
MIR4748-201
ENST00000578076
82 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.812-201
ENST00000610788
101 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.784-201
ENST00000613803
101 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.787-201
ENST00000616522
101 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.780-201
ENST00000617336
101 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.801-201
ENST00000619005
101 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD18C-201
ENST00000362704
69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-497P-201
ENST00000365316
104 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.343-201
ENST00000365354
112 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-520P-201
ENST00000384717
104 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
TRAJ33-201
ENST00000390504
57 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
AC097484.2-201
ENST00000509147
251 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
FTX_4.1-201
ENST00000616291
147 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.818-201
ENST00000618813
71 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
TARS-215
ENST00000626210
201 nt
TSL 5
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-797P-201
ENST00000363101
109 nt
BASIC
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□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-886P-201
ENST00000384319
105 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-649P-201
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107 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.501-201
ENST00000384467
103 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.611-201
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108 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-327P-201
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127 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
AL353621.2-201
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BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-694P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-196P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-129P-201
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107 nt
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-1.61
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.647-201
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-1.61
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.640-201
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BASIC
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□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.803-201
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112 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.815-201
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112 nt
BASIC
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□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.795-201
ENST00000619475
112 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.827-201
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112 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD113-3-201
ENST00000364830
72 nt
BASIC
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□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1324P-201
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107 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD116-24-201
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92 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.69-201
ENST00000362885
109 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1325P-201
ENST00000364905
105 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD116-22-201
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92 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.506-201
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102 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
MIR8053-201
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BASIC
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□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
SNORA63.4-201
ENST00000362763
126 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-912P-201
ENST00000363800
104 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-810P-201
ENST00000364001
107 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.261-201
ENST00000364631
102 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNA5SP173-201
ENST00000364857
136 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.349-201
ENST00000365406
102 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
MIR548N-201
ENST00000408742
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BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-141P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-255P-201
ENST00000516957
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BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
AC104211.3-201
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270 nt
TSL 3
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
SNORA63-201
ENST00000363450
132 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
RNY1P1-201
ENST00000364372
112 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.313-201
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BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD116-14-201
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BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD116-17-201
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BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD116-15-201
ENST00000384445
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BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD116-19-201
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92 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
SNORA17.4-201
ENST00000391287
132 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.321-201
ENST00000365149
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BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
UBQLN4
Q9NRR5
TRAJ9-201
ENST00000390528
61 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
UBQLN4
Q9NRR5
MIR1297-201
ENST00000637311
77 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-755P-201
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103 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
UBQLN4
Q9NRR5
RNY4P9-201
ENST00000363194
97 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1241P-201
ENST00000384536
107 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-68P-201
ENST00000516576
104 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
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