Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
APOFQ13790 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
APOFQ13790 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
APOFQ13790 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
APOFQ13790 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
APOFQ13790 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
APOFQ13790 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
APOFQ13790 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
APOFQ13790 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
APOFQ13790 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
APOFQ13790 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
APOFQ13790 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
APOFQ13790 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
APOFQ13790 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
APOFQ13790 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
APOFQ13790 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
APOFQ13790 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
APOFQ13790 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
APOFQ13790 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
APOFQ13790 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
APOFQ13790 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
APOFQ13790 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
APOFQ13790 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
APOFQ13790 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
APOFQ13790 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
APOFQ13790 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
APOFQ13790 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
APOFQ13790 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
APOFQ13790 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.34□□□□□ -2.78
APOFQ13790 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
APOFQ13790 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
APOFQ13790 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
APOFQ13790 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
APOFQ13790 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
APOFQ13790 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
APOFQ13790 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
APOFQ13790 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
APOFQ13790 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.37□□□□□ -2.79
APOFQ13790 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
APOFQ13790 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
APOFQ13790 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
APOFQ13790 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
APOFQ13790 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
APOFQ13790 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
APOFQ13790 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
APOFQ13790 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
APOFQ13790 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
APOFQ13790 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
APOFQ13790 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOFQ13790 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOFQ13790 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOFQ13790 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOFQ13790 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms