Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
APOFQ13790 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
APOFQ13790 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
APOFQ13790 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
APOFQ13790 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
APOFQ13790 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
APOFQ13790 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
APOFQ13790 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
APOFQ13790 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
APOFQ13790 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
APOFQ13790 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
APOFQ13790 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
APOFQ13790 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
APOFQ13790 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
APOFQ13790 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
APOFQ13790 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
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APOFQ13790 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
APOFQ13790 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
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APOFQ13790 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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APOFQ13790 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
APOFQ13790 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
APOFQ13790 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
APOFQ13790 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
APOFQ13790 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
APOFQ13790 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.34□□□□□ -2.78
APOFQ13790 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
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APOFQ13790 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
APOFQ13790 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
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APOFQ13790 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
APOFQ13790 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.37□□□□□ -2.79
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APOFQ13790 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
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APOFQ13790 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
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APOFQ13790 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
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APOFQ13790 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOFQ13790 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOFQ13790 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOFQ13790 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOFQ13790 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
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