Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHAF1BQ13112 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHAF1BQ13112 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CHAF1BQ13112 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CHAF1BQ13112 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
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