Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TTPAP49638 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TTPAP49638 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TTPAP49638 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TTPAP49638 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TTPAP49638 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TTPAP49638 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TTPAP49638 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.71□□□□□ -2.84
TTPAP49638 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TTPAP49638 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TTPAP49638 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TTPAP49638 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TTPAP49638 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TTPAP49638 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TTPAP49638 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TTPAP49638 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TTPAP49638 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TTPAP49638 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TTPAP49638 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
TTPAP49638 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TTPAP49638 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TTPAP49638 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TTPAP49638 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TTPAP49638 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TTPAP49638 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TTPAP49638 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TTPAP49638 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TTPAP49638 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TTPAP49638 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TTPAP49638 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TTPAP49638 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TTPAP49638 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TTPAP49638 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TTPAP49638 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.78□□□□□ -2.85
TTPAP49638 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.78□□□□□ -2.85
TTPAP49638 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.78□□□□□ -2.85
TTPAP49638 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TTPAP49638 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TTPAP49638 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TTPAP49638 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TTPAP49638 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TTPAP49638 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TTPAP49638 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TTPAP49638 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TTPAP49638 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TTPAP49638 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TTPAP49638 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TTPAP49638 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TTPAP49638 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TTPAP49638 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TTPAP49638 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
TTPAP49638 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TTPAP49638 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TTPAP49638 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TTPAP49638 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TTPAP49638 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TTPAP49638 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TTPAP49638 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TTPAP49638 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TTPAP49638 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TTPAP49638 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TTPAP49638 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TTPAP49638 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TTPAP49638 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TTPAP49638 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TTPAP49638 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TTPAP49638 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TTPAP49638 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TTPAP49638 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TTPAP49638 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TTPAP49638 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TTPAP49638 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TTPAP49638 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TTPAP49638 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TTPAP49638 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TTPAP49638 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TTPAP49638 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TTPAP49638 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TTPAP49638 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TTPAP49638 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TTPAP49638 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TTPAP49638 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TTPAP49638 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TTPAP49638 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TTPAP49638 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TTPAP49638 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TTPAP49638 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TTPAP49638 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TTPAP49638 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TTPAP49638 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TTPAP49638 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
TTPAP49638 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
TTPAP49638 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
TTPAP49638 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
TTPAP49638 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
TTPAP49638 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
TTPAP49638 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
TTPAP49638 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
TTPAP49638 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
TTPAP49638 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms