Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
PTPRMP28827 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
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PTPRMP28827 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
PTPRMP28827 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
PTPRMP28827 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
PTPRMP28827 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
PTPRMP28827 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
PTPRMP28827 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
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PTPRMP28827 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
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PTPRMP28827 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
PTPRMP28827 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
PTPRMP28827 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
PTPRMP28827 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
PTPRMP28827 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
PTPRMP28827 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
PTPRMP28827 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
PTPRMP28827 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
PTPRMP28827 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
PTPRMP28827 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
PTPRMP28827 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
PTPRMP28827 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
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