Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
PTPRDP23468 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
PTPRDP23468 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRDP23468 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.1 ms