Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRBP23467 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
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PTPRBP23467 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
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PTPRBP23467 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
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PTPRBP23467 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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PTPRBP23467 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRBP23467 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
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PTPRBP23467 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
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PTPRBP23467 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRBP23467 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
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