Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
POLE3Q9NRF9 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
POLE3Q9NRF9 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
POLE3Q9NRF9 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
POLE3Q9NRF9 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
POLE3Q9NRF9 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
POLE3Q9NRF9 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
POLE3Q9NRF9 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
POLE3Q9NRF9 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.67□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
POLE3Q9NRF9 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
POLE3Q9NRF9 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
POLE3Q9NRF9 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
POLE3Q9NRF9 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.6 ms