Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LHX9Q9NQ69 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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LHX9Q9NQ69 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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LHX9Q9NQ69 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LHX9Q9NQ69 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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