Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
UHRF1Q96T88 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
UHRF1Q96T88 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
UHRF1Q96T88 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
UHRF1Q96T88 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
UHRF1Q96T88 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
UHRF1Q96T88 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
UHRF1Q96T88 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.4 ms