Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SGCZQ96LD1 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SGCZQ96LD1 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SGCZQ96LD1 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SGCZQ96LD1 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SGCZQ96LD1 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SGCZQ96LD1 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SGCZQ96LD1 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SGCZQ96LD1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SGCZQ96LD1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SGCZQ96LD1 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SGCZQ96LD1 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SGCZQ96LD1 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.1 ms