Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CCDC47Q96A33 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.37□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CCDC47Q96A33 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CCDC47Q96A33 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.48□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
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