Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SSX9Q7RTT3 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-2.56□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.58□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.6□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.6□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SSX9Q7RTT3 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SSX9Q7RTT3 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SSX9Q7RTT3 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SSX9Q7RTT3 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
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