Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD4Q14839 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD4Q14839 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD4Q14839 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD4Q14839 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD4Q14839 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD4Q14839 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD4Q14839 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHD4Q14839 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD4Q14839 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD4Q14839 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD4Q14839 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms