Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1CQ13936 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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