Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
APOFQ13790 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
APOFQ13790 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
APOFQ13790 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
APOFQ13790 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
APOFQ13790 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOFQ13790 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOFQ13790 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOFQ13790 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOFQ13790 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOFQ13790 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOFQ13790 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOFQ13790 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOFQ13790 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOFQ13790 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOFQ13790 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOFQ13790 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOFQ13790 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOFQ13790 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOFQ13790 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOFQ13790 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOFQ13790 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOFQ13790 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOFQ13790 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOFQ13790 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOFQ13790 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOFQ13790 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOFQ13790 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
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APOFQ13790 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOFQ13790 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
APOFQ13790 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
APOFQ13790 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
APOFQ13790 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
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APOFQ13790 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
APOFQ13790 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
APOFQ13790 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
APOFQ13790 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
APOFQ13790 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
APOFQ13790 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
APOFQ13790 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
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APOFQ13790 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
APOFQ13790 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
APOFQ13790 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
APOFQ13790 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
APOFQ13790 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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APOFQ13790 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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APOFQ13790 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
APOFQ13790 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
APOFQ13790 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
APOFQ13790 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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APOFQ13790 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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APOFQ13790 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
APOFQ13790 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
APOFQ13790 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
APOFQ13790 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
APOFQ13790 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
APOFQ13790 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
APOFQ13790 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
APOFQ13790 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
APOFQ13790 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
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