Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TSPOP30536 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TSPOP30536 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TSPOP30536 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TSPOP30536 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TSPOP30536 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TSPOP30536 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TSPOP30536 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TSPOP30536 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TSPOP30536 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TSPOP30536 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TSPOP30536 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TSPOP30536 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TSPOP30536 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TSPOP30536 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TSPOP30536 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TSPOP30536 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TSPOP30536 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TSPOP30536 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TSPOP30536 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TSPOP30536 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TSPOP30536 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TSPOP30536 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TSPOP30536 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TSPOP30536 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TSPOP30536 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TSPOP30536 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TSPOP30536 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TSPOP30536 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TSPOP30536 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TSPOP30536 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TSPOP30536 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TSPOP30536 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TSPOP30536 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TSPOP30536 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TSPOP30536 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TSPOP30536 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TSPOP30536 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TSPOP30536 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TSPOP30536 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TSPOP30536 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TSPOP30536 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TSPOP30536 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TSPOP30536 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TSPOP30536 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
TSPOP30536 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TSPOP30536 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TSPOP30536 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TSPOP30536 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TSPOP30536 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TSPOP30536 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TSPOP30536 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TSPOP30536 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TSPOP30536 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
TSPOP30536 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TSPOP30536 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TSPOP30536 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TSPOP30536 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TSPOP30536 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TSPOP30536 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TSPOP30536 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TSPOP30536 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TSPOP30536 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TSPOP30536 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TSPOP30536 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TSPOP30536 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TSPOP30536 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TSPOP30536 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TSPOP30536 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TSPOP30536 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TSPOP30536 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms