Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
POLR1AO95602 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-4.38□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.11
POLR1AO95602 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-4.46□□□□□ -3.12
POLR1AO95602 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-4.47□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
POLR1AO95602 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
POLR1AO95602 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
POLR1AO95602 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
POLR1AO95602 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
POLR1AO95602 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
POLR1AO95602 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-4.54□□□□□ -3.14
POLR1AO95602 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
POLR1AO95602 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-4.55□□□□□ -3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.8 ms