Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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NIPSNAP3AQ9UFN0 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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