Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SMIM19Q96E16 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SMIM19Q96E16 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SMIM19Q96E16 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.98□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-3.03□□□□□ -2.89
SMIM19Q96E16 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SMIM19Q96E16 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SMIM19Q96E16 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
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