Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.92□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TOP1MTQ969P6 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TOP1MTQ969P6 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms