Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CTF1Q16619 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CTF1Q16619 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CTF1Q16619 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms