Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
USF2Q15853 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
USF2Q15853 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
USF2Q15853 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
USF2Q15853 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
USF2Q15853 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
USF2Q15853 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
USF2Q15853 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
USF2Q15853 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
USF2Q15853 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
USF2Q15853 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
USF2Q15853 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
USF2Q15853 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
USF2Q15853 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
USF2Q15853 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
USF2Q15853 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
USF2Q15853 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
USF2Q15853 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
USF2Q15853 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
USF2Q15853 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
USF2Q15853 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
USF2Q15853 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
USF2Q15853 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
USF2Q15853 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
USF2Q15853 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
USF2Q15853 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
USF2Q15853 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
USF2Q15853 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
USF2Q15853 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
USF2Q15853 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
USF2Q15853 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
USF2Q15853 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
USF2Q15853 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
USF2Q15853 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
USF2Q15853 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
USF2Q15853 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
USF2Q15853 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
USF2Q15853 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
USF2Q15853 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
USF2Q15853 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
USF2Q15853 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
USF2Q15853 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
USF2Q15853 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
USF2Q15853 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
USF2Q15853 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
USF2Q15853 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
USF2Q15853 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
USF2Q15853 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
USF2Q15853 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
USF2Q15853 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
USF2Q15853 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
USF2Q15853 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
USF2Q15853 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
USF2Q15853 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
USF2Q15853 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
USF2Q15853 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
USF2Q15853 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
USF2Q15853 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
USF2Q15853 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
USF2Q15853 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
USF2Q15853 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
USF2Q15853 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
USF2Q15853 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
USF2Q15853 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
USF2Q15853 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
USF2Q15853 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
USF2Q15853 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
USF2Q15853 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
USF2Q15853 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
USF2Q15853 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
USF2Q15853 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
USF2Q15853 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
USF2Q15853 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
USF2Q15853 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
USF2Q15853 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
USF2Q15853 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
USF2Q15853 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
USF2Q15853 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
USF2Q15853 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
USF2Q15853 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
USF2Q15853 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
USF2Q15853 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
USF2Q15853 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
USF2Q15853 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
USF2Q15853 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
USF2Q15853 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.1 ms