Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERPUD1Q15011 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERPUD1Q15011 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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HERPUD1Q15011 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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HERPUD1Q15011 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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HERPUD1Q15011 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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HERPUD1Q15011 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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HERPUD1Q15011 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERPUD1Q15011 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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HERPUD1Q15011 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERPUD1Q15011 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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