Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
RPA4Q13156 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
RPA4Q13156 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
RPA4Q13156 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
RPA4Q13156 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RPA4Q13156 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RPA4Q13156 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RPA4Q13156 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RPA4Q13156 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RPA4Q13156 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RPA4Q13156 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
RPA4Q13156 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
RPA4Q13156 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
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