Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TRDMT1O14717 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.02□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TRDMT1O14717 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRDMT1O14717 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRDMT1O14717 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRDMT1O14717 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRDMT1O14717 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRDMT1O14717 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRDMT1O14717 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRDMT1O14717 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
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