Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms