Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms